5 logiciels de caryotypage automatisé pour cartographier vos chromosomes

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Le caryotypage est le processus de commande et d'appariement de tous les chromosomes trouvés dans un organisme afin d'obtenir une vue globale de la "carte" des chromosomes complets d'un individu.

Mais assurons-nous d’abord de bien comprendre ce que sont les chromosomes. Les chromosomes sont des structures qui ressemblent aux fils contenus dans le noyau de chacune des cellules de votre corps.

Chaque structure de chromosome contient l'intégralité du plan d'information génétique de votre corps. Cela dicte la manière dont votre corps est structuré, réagit aux stimuli, aux prédispositions aux maladies, etc. Les femmes ont 2 chromosomes «X» et les hommes un chromosome «X» et un chromosome «Y». Chaque cellule de votre corps contient 23 paires de chromosomes, soit 46 chromosomes au total.

Pour permettre aux chercheurs de comprendre les séquences de chromosomes de chaque patient, ils utilisent un logiciel de caryotypage . Ce type de logiciel est conçu pour effectuer une analyse chromosomique et évalue la structure et le nombre de chromosomes d'une personne. Ce faisant, les chercheurs et les scientifiques peuvent détecter des anomalies.

Dans cet article, nous allons explorer d’excellentes options logicielles vous permettant d’effectuer des analyses de caryotypage.

Les 5 meilleurs outils de caryotypage automatisé à utiliser en 2019

1

ArgusSoft

ArgusSoft est une excellente option logicielle qui vous permet de caryotyper automatiquement les chromosomes humains par position de bande et peut également être utilisé pour le caryotypage en ligne de chromosomes d'animaux et de plantes.

Principales caractéristiques:

  • Coloration G, Q, R
  • Caryotypage automatisé de chromosomes humains avec reconnaissance des coudes
  • Caryotypage automatisé des chromosomes de porc
  • 3 bases intégrées d'idéogrammes standard de chromosomes humains avec différents niveaux de clairance - niveaux 400, 550 et 850
  • Peut ajouter des bases d'idéogrammes standard du cromosome pour d'autres espèces animales et végétales
  • Méthodes de préparation des échantillons
  • Saisie d'images de plaques en métaphase à l'aide d'une caméra et d'un scanner
  • Accompagner une image avec des graphiques
  • Division automatisée des chromosomes appliqués et en contact
  • Comparaison de chromosomes et d'idéogrammes

Vous pouvez également utiliser ArgusSoft pour former le système de reconnaissance des chromosomes à l'aide de préparations prédéfinies, transférer des images de plaques en métaphase et des caryogrammes dans une base de données intégrée, produire des modèles de rapports, corriger les caryogrammes et stocker et imprimer des images et des résultats d'analyse.

Vous pouvez obtenir une formation et un soutien pour utiliser ArgusSoft à partir de leur site officiel. Le centre de support comprend des services de formation, de maintenance et de conseil.

Essayez ArgusSoft

2

HiBand par imagerie spectrale appliquée

HiBand est un logiciel créé par Applied Spectral Imaging, capable d’effectuer une analyse chromosomique avancée à l’aide de fonctions de caryotypage numérique. Ce logiciel

utilise des fonctionnalités de balayage automatisé pour une analyse en profondeur de la structure du chromosome.

Vous pouvez utiliser le large éventail de fonctionnalités de HiBand pour indexer, compter, stocker et gérer les données de résultats. Vous pouvez également utiliser ce logiciel puissant pour numériser automatiquement la séquence de chromosomes.

Les résultats obtenus en utilisant les fonctionnalités de caryotypage trouvées dans HiBand peuvent être stockés dans un emplacement sécurisé avec des couches protégées par un mot de passe et cryptées. Cela vous permet d'avoir l'esprit tranquille en ce qui concerne la perte de données de séquençage importantes, ce qui améliore également l'efficacité de votre laboratoire.

Le tri des résultats s’effectue très facilement. Il vous suffit de rechercher une séquence spécifique de chromosomes. Tous les résultats sont affichés dans un écran bien contenu qui offre un accès facile à la modification, à la relecture et à l’ajout de balises. des fichiers.

Principales caractéristiques:

  • Brightary Karyotyping-G-Band et R-Band
  • Caryotypage par fluorescence - bande Q, bande R et FISH
  • Caryotypage spectral
  • Comptage automatique des chromosomes
  • Indexation et classification des chromosomes
  • Séparation avancée des chromosomes et amélioration d'image avancée
  • Galerie d'images - peut présenter toutes les métaphases et caryotypes de cas sur un seul écran
  • Peut comparer les chromosomes - les voir côte à côte
  • Idéogramme aberrant - vous pouvez ajouter des chromosomes, des cellules, des idéogrammes et des annotations dans un générateur d'images

HiBand utilise des flux de travail entièrement automatisés pour accroître l’efficacité des laboratoires, dispose de fonctions de numérisation «au départ et à la sortie», recherche les métaphases, lit automatiquement les codes à barres, télécharge les images en temps réel lors de la numérisation des diapositives et les exporte également vers le portail central LIS du laboratoire et Base de données.

Essayez HiBand

3

Ikaros par MetaSystems

Ce système de caryotypage possède une interface utilisateur très intuitive qui offre toutes les fonctionnalités sur un seul écran. Cela permet un accès facile et rapide à toutes les informations obtenues.

Ikaros peut être utilisé avec Neon, une plate-forme conçue pour vous aider avec les données d'image et l'organisation des cas. Neon collecte les données de tous les travaux d’imagerie et de sources externes et vous permet de les présenter de manière simple à l’aide d’un tableau de bord de gestion des cas.

Cet outil vous permet de toujours avoir des informations importantes à portée de main et stockées de manière sécurisée, mais utilise des algorithmes de gestion de données très puissants, dispose d'une belle gamme de façons d'observer les données et peut fournir des recherches spécifiques basées sur des mots-clés et des caractéristiques de données.

Découvrez plus d'informations sur Neon et ses fonctionnalités ici .

Ikaros prend en charge de nombreuses techniques de bandes différentes - bandes R et bandes Brightfield, bandes Q à fluorescence, bandes R et FISH -, offre un grand nombre de formes de caryogrammes prédéfinis pour les humains, les plantes et les animaux. Vous pouvez facilement modifier ces formulaires pour ajouter les données requises pour le type de recherche que vous effectuez.

Le fait que vous puissiez comparer les chromosomes par classe ou par caryogramme vous offre des informations extrêmement utiles vous permettant d'identifier facilement les différences.

Essayez Ikaros

4

MetaClass de Microptic

MetaClass est un excellent logiciel caryotyopique conçu de manière modulaire. Ce logiciel vous aide à effectuer des études de caryotypage et d’étude FISH des chromosomes.

MetaClass est constitué des modules suivants:

  • Base de données MetaClass

Base de données pouvant être installée avec n’importe quel module de MetaClass. Vous permet de stocker les détails du patient et vous donne un accès facile aux résultats. Vous pouvez créer des rapports personnalisés dans n'importe quelle langue avec ce module.

  • MetaClass Karyotyping

Vous permet d’étudier un caryotype une fois que les images de la phase de préparation de la métaphase ont été numérisées et de les disposer par paires en fonction de la taille, de la position, etc. Ce module vous donne des résultats d’excellente qualité en matière de bandes de chromosomes. vous fournir des rapports d'aspect professionnel.

Les principales caractéristiques comprennent:

  • L’étude du caryotype est analysée sous un grossissement 100X en fond clair
  • Peut capturer plusieurs images de métaphase
  • La qualité d'image est modifiable pour des résultats plus nets
  • Classification automatique des chromosomes
  • 4 vues d'écran - Fenêtre des chromosomes Metaphase, Karyotype et Unclassified
  • Peut afficher des prototypes de chromosomes
  • Les chromosomes non classés peuvent être corrigés automatiquement ou manuellement - superpositions, séparation, croisements, rotations, etc.
  • Les fichiers de session MTC ou les images BMP peuvent être enregistrés et rechargés à tout moment
  • Peut exporter des chromosomes individuels vers la base de données Metaclass avec la possibilité d'ajouter des commentaires et des notes

Voici un exemple de rapport de caryotypage Metaclass.

  • MetaClass FISH

Ceci est un module d’analyse qui vous permet d’obtenir une image d’hybridation FISH (Fluorescent IN SITU). Ce module capture des images à l’aide de sondes ADN fluorescentes et vous permet de confirmer des anomalies génétiques - trisomies, sélections partielles, sélections, réarrangements de chromosomes, etc.

Les images FISH sont analysées avec un grossissement de 100 fois et, pour une plage de netteté supérieure, peuvent également capturer des images avec différents filtres.

Si vous souhaitez en savoir plus sur les modules présentés ci-dessus et sur d'autres fonctionnalités, vous pouvez consulter le catalogue MetaClass.

Si vous êtes un type curieux et que vous voulez voir un rapport obtenu en utilisant la méthode FISH, vous pouvez

un exemple de fichier PDF.

Essayez MetaClass

5

GenASis Bandview

GenASis Bandview est un autre excellent logiciel de caryotypage construit à partir de modules de différentes capacités. Vous pouvez utiliser cette application pour effectuer des diagnostics de caryotypage et obtenir des résultats de test précis.

Ce logiciel vous permet de personnaliser entièrement le flux de travail et le processus de diagnostic, en fonction des besoins de votre entreprise et des objectifs que vous essayez d'atteindre.

La large gamme d'outils fournis dans BandView est facilement accessible d'un simple clic de souris et offre une puissante expérience de caryotypage G / R / C / Q-Band. Vous pouvez choisir entre un flux de travail automatisé ou manuel lorsqu'il s'agit de localiser des métaphases et de capturer des images.

Les anomalies chromosomiques, si elles sont détectées, peuvent être observées par addition, suppression ou réarrangement du matériel génétique du patient. Avec BandView, vous pouvez utiliser la technique moléculaire utilisant la bande FISH.

FISH utilise des sondes fluorescentes pour s’attacher à différentes parties du chromosome, ce qui permet au logiciel de détecter et de localiser les anormalités présentes dans des séquences d’ADN spécifiques.

Essayez GenASis Bandview

Conclusion

Dans cet article, nous avons exploré certains des meilleurs logiciels de caryotypage automatisé existants sur le marché à la fin de 2018.

Les options logicielles de caryotypage couvertes dans cet article vous offrent une variété de fonctionnalités qui vous aideront à atteindre les objectifs de votre entreprise.

En utilisant ce type de logiciel, vous pouvez compter rapidement des milliers de structures de chromosomes, analyser avec différentes techniques professionnelles et produire des rapports de haute qualité qui vous permettront d'identifier facilement les anomalies.

Nous aimerions connaître votre opinion sur les logiciels que nous avons présentés dans cette liste des 5 meilleurs. N'hésitez pas à nous le faire savoir en utilisant la section commentaire ci-dessous.

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